Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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