Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITSN1Q15811 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITSN1Q15811 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITSN1Q15811 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITSN1Q15811 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ITSN1Q15811 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITSN1Q15811 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms