Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HMGN3Q15651 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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