Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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