Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
HDAC1Q13547 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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