Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RIGQ13278 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms