Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATRXP46100 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATRXP46100 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATRXP46100 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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