Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
J3KRW8 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
J3KRW8 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
J3KRW8 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms