Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms