Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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UBR3Q6ZT12 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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UBR3Q6ZT12 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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UBR3Q6ZT12 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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UBR3Q6ZT12 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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UBR3Q6ZT12 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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UBR3Q6ZT12 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
UBR3Q6ZT12 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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UBR3Q6ZT12 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
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UBR3Q6ZT12 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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UBR3Q6ZT12 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
UBR3Q6ZT12 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
UBR3Q6ZT12 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
UBR3Q6ZT12 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
UBR3Q6ZT12 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
UBR3Q6ZT12 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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