Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms