Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CCINQ13939 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms