Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
APOFQ13790 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
APOFQ13790 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
APOFQ13790 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
APOFQ13790 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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APOFQ13790 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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