Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEUROD1Q13562 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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