Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TCOF1Q13428 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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