Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATMQ13315 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATMQ13315 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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