Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms