Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAF1Q13077 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms