Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CPSF1Q10570 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CPSF1Q10570 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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