Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
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PTPRMP28827 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRMP28827 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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PTPRMP28827 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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PTPRMP28827 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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PTPRMP28827 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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PTPRMP28827 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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PTPRMP28827 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRMP28827 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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