Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CRXO43186 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CRXO43186 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CRXO43186 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms