Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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