Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TPRNQ4KMQ1 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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