Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms