Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALX1Q15699 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALX1Q15699 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms