Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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TAF1AQ15573 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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TAF1AQ15573 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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TAF1AQ15573 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TAF1AQ15573 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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