Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms