Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms