Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCINQ13939 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCINQ13939 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CCINQ13939 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCINQ13939 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCINQ13939 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCINQ13939 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCINQ13939 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms