Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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