Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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PRPF4BQ13523 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRPF4BQ13523 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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