Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PICALMQ13492 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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