Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
XRCC4Q13426 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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