Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
BPTFQ12830 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms