Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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