Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms