Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CGGBP1Q9UFW8 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CGGBP1Q9UFW8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CGGBP1Q9UFW8 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CGGBP1Q9UFW8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CGGBP1Q9UFW8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CGGBP1Q9UFW8 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CGGBP1Q9UFW8 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CGGBP1Q9UFW8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CGGBP1Q9UFW8 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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