Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFDQ9GZP0 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFDQ9GZP0 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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