Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TTC9Q92623 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms