Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SCN9AQ15858 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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