Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNA6Q15825 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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