Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SCARB2Q14108 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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