Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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FOXE3Q13461 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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