Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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TCOF1Q13428 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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TCOF1Q13428 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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TCOF1Q13428 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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TCOF1Q13428 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TCOF1Q13428 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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