Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIN2BQ13224 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIN2BQ13224 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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