Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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