Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
IFFO1Q0D2I5 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.59□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
IFFO1Q0D2I5 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms