Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRGP23470 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRGP23470 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms