Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Top3bQ9Z321 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top3bQ9Z321 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms