Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.5 ms